Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms