Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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TUBB3Q13509 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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TUBB3Q13509 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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TUBB3Q13509 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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TUBB3Q13509 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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TUBB3Q13509 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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TUBB3Q13509 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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TUBB3Q13509 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBB3Q13509 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
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