Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms