Protein–RNA interactions for Protein: Q01167

FOXK2, Forkhead box protein K2, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXK2Q01167 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXK2Q01167 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXK2Q01167 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXK2Q01167 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXK2Q01167 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXK2Q01167 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXK2Q01167 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXK2Q01167 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXK2Q01167 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXK2Q01167 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXK2Q01167 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXK2Q01167 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXK2Q01167 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXK2Q01167 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXK2Q01167 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXK2Q01167 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXK2Q01167 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXK2Q01167 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXK2Q01167 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXK2Q01167 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXK2Q01167 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXK2Q01167 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXK2Q01167 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXK2Q01167 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXK2Q01167 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXK2Q01167 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXK2Q01167 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXK2Q01167 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXK2Q01167 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXK2Q01167 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXK2Q01167 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXK2Q01167 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXK2Q01167 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXK2Q01167 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms