Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK17Q00537 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK17Q00537 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms