Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPBLQ6KC79 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.416e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.376e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 PTBP1-209ENST00000586481 578 ntTSL 317.33■□□□□ 0.366e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.356e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.36e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.166e-6■□□□□ 9
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NIPBLQ6KC79 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.136e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 SLC6A6-206ENST00000615188 689 ntTSL 315.37■□□□□ 0.056e-6■□□□□ 9
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NIPBLQ6KC79 SLC6A6-209ENST00000622176 1116 ntTSL 1 (best)14.64□□□□□ -0.076e-6■□□□□ 9
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NIPBLQ6KC79 GANAB-206ENST00000526392 257 ntTSL 314.57□□□□□ -0.086e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 SLC6A6-203ENST00000610642 1983 ntTSL 214.38□□□□□ -0.116e-6■□□□□ 9
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NIPBLQ6KC79 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.266e-6■□□□□ 9
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NIPBLQ6KC79 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.356e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 PDAP1-204ENST00000496335 302 ntTSL 312.63□□□□□ -0.396e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.46e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.426e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 AGAP3-221ENST00000490097 604 ntTSL 412.39□□□□□ -0.436e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.446e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.486e-6■□□□□ 9
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NIPBLQ6KC79 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.56e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.526e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.546e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 GANAB-212ENST00000534419 640 ntTSL 411.54□□□□□ -0.566e-6■□□□□ 9
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NIPBLQ6KC79 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.626e-6■□□□□ 9
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NIPBLQ6KC79 NSD2-220ENST00000509115 1212 ntTSL 210.48□□□□□ -0.736e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 NSD2-222ENST00000512700 1095 ntTSL 510.48□□□□□ -0.736e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 AGAP3-214ENST00000476375 1019 ntTSL 510.34□□□□□ -0.756e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 NSD2-218ENST00000508355 2092 ntTSL 1 (best)10.33□□□□□ -0.766e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 PTBP1-211ENST00000587094 273 ntTSL 310.32□□□□□ -0.766e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 PTBP1-216ENST00000590887 642 ntTSL 310.25□□□□□ -0.776e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 EIF2B3-203ENST00000372183 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.796e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 YWHAB-201ENST00000353703 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.846e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 YWHAB-206ENST00000479421 1097 ntTSL 59.55□□□□□ -0.886e-6■□□□□ 9
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NIPBLQ6KC79 MAGOH-204ENST00000495868 695 ntTSL 1 (best)9.18□□□□□ -0.946e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 NSD2-227ENST00000515806 816 ntTSL 39.08□□□□□ -0.966e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 YWHAB-202ENST00000372839 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.976e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 GANAB-209ENST00000529737 577 ntTSL 48.83□□□□□ -16e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 GANAB-215ENST00000534779 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.066e-6■□□□□ 9
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NIPBLQ6KC79 MAGOH-201ENST00000371466 500 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.196e-6■□□□□ 9
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NIPBLQ6KC79 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.256e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.266e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 GANAB-202ENST00000356638 3608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.276e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.286e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 GANAB-201ENST00000346178 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.36e-6■□□□□ 9
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NIPBLQ6KC79 TXLNA-202ENST00000373610 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.356e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.426e-6■□□□□ 9
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NIPBLQ6KC79 WARS-213ENST00000554084 866 ntTSL 55.24□□□□□ -1.576e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 SLC6A6-210ENST00000622186 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.596e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 SLC6A6-207ENST00000618278 6401 ntTSL 55.05□□□□□ -1.66e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 ABL1-203ENST00000393293 532 ntTSL 54.99□□□□□ -1.616e-6■□□□□ 9
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NIPBLQ6KC79 PICALM-217ENST00000531930 703 ntTSL 51.23□□□□□ -2.216e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.21□□□□□ -2.222e-12■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.266e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 SMC4-218ENST00000486711 621 ntTSL 20.37□□□□□ -2.356e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 SMC4-220ENST00000488017 592 ntTSL 40.29□□□□□ -2.366e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 IARS-212ENST00000498025 707 ntTSL 30.13□□□□□ -2.396e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 LYPLAL1-207ENST00000475724 1715 ntTSL 3-0.44□□□□□ -2.486e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 PICALM-216ENST00000531771 631 ntTSL 3-0.65□□□□□ -2.516e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 PRPF4B-209ENST00000494674 1727 ntTSL 57.95□□□□□ -1.143e-13■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 PRPF4B-208ENST00000490653 581 ntTSL 26.67□□□□□ -1.343e-13■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 PRPF4B-206ENST00000481109 2364 ntTSL 1 (best)6.44□□□□□ -1.383e-13■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 PRPF4B-203ENST00000463634 2590 ntTSL 56.05□□□□□ -1.443e-13■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.813e-13■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 PRPF4B-205ENST00000480058 6775 ntTSL 1 (best)3.72□□□□□ -1.813e-13■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 HNRNPU-229ENST00000640440 871 ntTSL 312.84□□□□□ -0.352e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 HNRNPU-228ENST00000640306 2917 ntTSL 512.09□□□□□ -0.472e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 HNRNPU-214ENST00000638475 2698 ntTSL 511.58□□□□□ -0.562e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.62e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 HNRNPU-209ENST00000476241 4844 ntTSL 59.9□□□□□ -0.822e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 HNRNPU-217ENST00000638952 5678 ntTSL 58.89□□□□□ -0.992e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.082e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 HNRNPU-224ENST00000640056 2045 ntTSL 58.1□□□□□ -1.112e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.172e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 SF3B2-208ENST00000529994 1004 ntTSL 210.8□□□□□ -0.682e-6■□□□□ 9
NIPBLQ6KC79 SUPT6H-202ENST00000347486 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.59e-7■□□□□ 9
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