Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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ODF1Q14990 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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ODF1Q14990 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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ODF1Q14990 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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ODF1Q14990 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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ODF1Q14990 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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ODF1Q14990 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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ODF1Q14990 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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ODF1Q14990 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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ODF1Q14990 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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ODF1Q14990 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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ODF1Q14990 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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