Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms