Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSDMDP57764 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GSDMDP57764 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms