Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.95■■■■□ 3.51
GSDMDP57764 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
GSDMDP57764 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
GSDMDP57764 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
GSDMDP57764 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
GSDMDP57764 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
GSDMDP57764 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
GSDMDP57764 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
GSDMDP57764 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.62■■■■□ 3.29
GSDMDP57764 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
GSDMDP57764 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
GSDMDP57764 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
GSDMDP57764 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
GSDMDP57764 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
GSDMDP57764 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
GSDMDP57764 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
GSDMDP57764 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
GSDMDP57764 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
GSDMDP57764 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
GSDMDP57764 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
GSDMDP57764 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
GSDMDP57764 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
GSDMDP57764 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
GSDMDP57764 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
GSDMDP57764 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GSDMDP57764 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
GSDMDP57764 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
GSDMDP57764 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
GSDMDP57764 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
GSDMDP57764 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
GSDMDP57764 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
GSDMDP57764 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
GSDMDP57764 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
GSDMDP57764 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GSDMDP57764 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
GSDMDP57764 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
GSDMDP57764 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GSDMDP57764 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GSDMDP57764 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
GSDMDP57764 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
GSDMDP57764 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
GSDMDP57764 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
GSDMDP57764 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
GSDMDP57764 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GSDMDP57764 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
GSDMDP57764 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
GSDMDP57764 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
GSDMDP57764 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
GSDMDP57764 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
GSDMDP57764 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GSDMDP57764 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
GSDMDP57764 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
GSDMDP57764 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
GSDMDP57764 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
GSDMDP57764 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
GSDMDP57764 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
GSDMDP57764 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
GSDMDP57764 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
GSDMDP57764 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
GSDMDP57764 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GSDMDP57764 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GSDMDP57764 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
GSDMDP57764 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GSDMDP57764 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GSDMDP57764 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GSDMDP57764 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
GSDMDP57764 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
GSDMDP57764 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GSDMDP57764 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
GSDMDP57764 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
GSDMDP57764 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
GSDMDP57764 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
GSDMDP57764 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GSDMDP57764 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GSDMDP57764 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
GSDMDP57764 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GSDMDP57764 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
GSDMDP57764 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
GSDMDP57764 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GSDMDP57764 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
GSDMDP57764 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GSDMDP57764 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
GSDMDP57764 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GSDMDP57764 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GSDMDP57764 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GSDMDP57764 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GSDMDP57764 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GSDMDP57764 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GSDMDP57764 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
GSDMDP57764 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GSDMDP57764 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GSDMDP57764 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
GSDMDP57764 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
GSDMDP57764 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
GSDMDP57764 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
GSDMDP57764 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
GSDMDP57764 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GSDMDP57764 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GSDMDP57764 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
GSDMDP57764 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms