Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP1P29466 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP1P29466 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP1P29466 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP1P29466 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP1P29466 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASP1P29466 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASP1P29466 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASP1P29466 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASP1P29466 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASP1P29466 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASP1P29466 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASP1P29466 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP1P29466 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP1P29466 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP1P29466 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP1P29466 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP1P29466 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP1P29466 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP1P29466 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP1P29466 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP1P29466 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP1P29466 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP1P29466 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP1P29466 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP1P29466 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP1P29466 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP1P29466 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP1P29466 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP1P29466 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP1P29466 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP1P29466 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP1P29466 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP1P29466 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP1P29466 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP1P29466 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP1P29466 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP1P29466 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP1P29466 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP1P29466 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP1P29466 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP1P29466 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP1P29466 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP1P29466 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP1P29466 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP1P29466 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP1P29466 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP1P29466 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP1P29466 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP1P29466 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP1P29466 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP1P29466 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP1P29466 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP1P29466 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP1P29466 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP1P29466 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP1P29466 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP1P29466 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP1P29466 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP1P29466 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP1P29466 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP1P29466 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP1P29466 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP1P29466 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP1P29466 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP1P29466 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP1P29466 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP1P29466 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP1P29466 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP1P29466 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP1P29466 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP1P29466 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP1P29466 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP1P29466 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP1P29466 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP1P29466 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP1P29466 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP1P29466 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP1P29466 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP1P29466 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP1P29466 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP1P29466 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP1P29466 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP1P29466 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP1P29466 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP1P29466 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP1P29466 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP1P29466 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP1P29466 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP1P29466 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP1P29466 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP1P29466 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP1P29466 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP1P29466 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP1P29466 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP1P29466 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP1P29466 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP1P29466 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP1P29466 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP1P29466 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms