Protein–RNA interactions for Protein: P20138

CD33, Myeloid cell surface antigen CD33, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD33P20138 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD33P20138 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD33P20138 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD33P20138 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD33P20138 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD33P20138 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD33P20138 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD33P20138 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD33P20138 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD33P20138 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD33P20138 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD33P20138 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD33P20138 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD33P20138 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CD33P20138 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD33P20138 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD33P20138 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD33P20138 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD33P20138 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD33P20138 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD33P20138 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD33P20138 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD33P20138 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD33P20138 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD33P20138 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD33P20138 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD33P20138 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD33P20138 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD33P20138 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD33P20138 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD33P20138 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD33P20138 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD33P20138 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD33P20138 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD33P20138 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD33P20138 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD33P20138 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD33P20138 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CD33P20138 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD33P20138 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD33P20138 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD33P20138 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD33P20138 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD33P20138 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD33P20138 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD33P20138 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD33P20138 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD33P20138 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD33P20138 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD33P20138 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD33P20138 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD33P20138 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD33P20138 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD33P20138 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD33P20138 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD33P20138 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD33P20138 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD33P20138 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD33P20138 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD33P20138 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD33P20138 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD33P20138 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD33P20138 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD33P20138 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD33P20138 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD33P20138 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD33P20138 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD33P20138 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD33P20138 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD33P20138 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD33P20138 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD33P20138 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD33P20138 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD33P20138 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD33P20138 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD33P20138 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD33P20138 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD33P20138 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD33P20138 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD33P20138 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD33P20138 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD33P20138 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD33P20138 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD33P20138 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD33P20138 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD33P20138 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD33P20138 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD33P20138 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD33P20138 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD33P20138 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD33P20138 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD33P20138 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD33P20138 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD33P20138 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD33P20138 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD33P20138 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD33P20138 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD33P20138 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD33P20138 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD33P20138 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms