Protein–RNA interactions for Protein: P0C866

LINC00869, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00869, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00869P0C866 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms