Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms