Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ODF1Q14990 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms