Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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