Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUCB1Q02818 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms