Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS28P62857 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS28P62857 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS28P62857 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS28P62857 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS28P62857 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS28P62857 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS28P62857 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS28P62857 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS28P62857 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS28P62857 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS28P62857 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS28P62857 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS28P62857 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS28P62857 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS28P62857 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS28P62857 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS28P62857 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS28P62857 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS28P62857 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS28P62857 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS28P62857 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS28P62857 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS28P62857 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS28P62857 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS28P62857 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS28P62857 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS28P62857 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS28P62857 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS28P62857 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS28P62857 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS28P62857 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS28P62857 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS28P62857 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS28P62857 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS28P62857 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS28P62857 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS28P62857 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS28P62857 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS28P62857 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS28P62857 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS28P62857 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS28P62857 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS28P62857 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS28P62857 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS28P62857 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS28P62857 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS28P62857 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS28P62857 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS28P62857 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS28P62857 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS28P62857 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS28P62857 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS28P62857 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS28P62857 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS28P62857 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS28P62857 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS28P62857 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS28P62857 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS28P62857 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS28P62857 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS28P62857 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS28P62857 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS28P62857 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS28P62857 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS28P62857 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS28P62857 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS28P62857 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS28P62857 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS28P62857 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS28P62857 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS28P62857 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS28P62857 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS28P62857 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS28P62857 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS28P62857 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS28P62857 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS28P62857 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS28P62857 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS28P62857 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS28P62857 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS28P62857 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS28P62857 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS28P62857 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS28P62857 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS28P62857 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS28P62857 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS28P62857 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS28P62857 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS28P62857 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS28P62857 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS28P62857 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS28P62857 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS28P62857 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS28P62857 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS28P62857 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS28P62857 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS28P62857 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS28P62857 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS28P62857 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms