Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1G8

TRBV10-2, T-cell receptor beta variable 10-2 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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