Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1G8

TRBV10-2, T-cell receptor beta variable 10-2 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRBV10-2A0A0K0K1G8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRBV10-2A0A0K0K1G8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRBV10-2A0A0K0K1G8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRBV10-2A0A0K0K1G8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRBV10-2A0A0K0K1G8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRBV10-2A0A0K0K1G8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV10-2A0A0K0K1G8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRBV10-2A0A0K0K1G8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRBV10-2A0A0K0K1G8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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