Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8H2

KRTAP5-3, Keratin-associated protein 5-3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP5-3Q6L8H2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 KCNMA1-208ENST00000372440 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 KCNMA1-233ENST00000638351 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 SLC8A1-201ENST00000332839 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 DYNC2LI1-203ENST00000398823 2903 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 ATAT1-205ENST00000376483 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 KRT17P7-202ENST00000582261 2334 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 LRRC8E-201ENST00000306708 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 SFTPB-207ENST00000519937 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 PRPH2-201ENST00000230381 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 SEMA4A-203ENST00000368284 2981 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 WARS-201ENST00000344102 2690 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 UBIAD1-202ENST00000376810 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 SLC12A4-209ENST00000572037 3620 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 OR10K2-202ENST00000641042 3023 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 CES5A-201ENST00000290567 2084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 RALBP1-206ENST00000609094 3676 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 LARP1B-203ENST00000432347 2707 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 TNIP1-218ENST00000523338 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 SGK1-201ENST00000237305 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 CLU-201ENST00000316403 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 MASTL-202ENST00000375940 3080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 AL049839.2-201ENST00000553947 3067 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 SLC16A14-201ENST00000295190 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 PDP1-202ENST00000396200 4358 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 DRD1-201ENST00000393752 4054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 PAX8-205ENST00000429538 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 RRM2-213ENST00000641198 3431 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 RUNX1T1-204ENST00000422361 2450 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 ZNF790-208ENST00000615484 2451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 C2CD5-218ENST00000545552 3471 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 BAIAP2-AS1-202ENST00000577066 4465 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 TMEFF2-202ENST00000392314 2842 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 AC012313.5-201ENST00000594816 2517 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 AC113208.3-201ENST00000637356 2523 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 DLG2-218ENST00000524982 2872 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 ZIK1-207ENST00000599456 2860 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 TCTN2-201ENST00000303372 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 VWFP1-201ENST00000457911 2907 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 ZWILCH-202ENST00000446801 3256 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 WDR41-201ENST00000296679 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 CCDC36-201ENST00000296449 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 VIPAS39-201ENST00000327028 2614 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 EPHB6-211ENST00000619012 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 LRTOMT-201ENST00000289488 2332 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 KDM2B-219ENST00000611216 3434 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 AC004490.1-201ENST00000585593 2738 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.5 ms