Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 YY1AP1-202ENST00000311573 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.133e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 PTPRS-202ENST00000353284 4518 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.143e-9■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 FADS1-220ENST00000545405 582 ntTSL 214.04□□□□□ -0.163e-9■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 FADS1-214ENST00000540767 742 ntTSL 313.97□□□□□ -0.173e-9■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 PTPRS-201ENST00000262963 4766 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.213e-9■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 PTPRS-210ENST00000592099 4766 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.213e-9■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 ILF3-220ENST00000590869 531 ntTSL 513.69□□□□□ -0.223e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 CLIC1-207ENST00000375780 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.313e-9■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 YY1AP1-209ENST00000368330 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.373e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 AC105402.3-201ENST00000601658 784 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.493e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 YY1AP1-204ENST00000354691 2498 ntTSL 211.76□□□□□ -0.533e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 FADS1-210ENST00000496123 693 ntTSL 511.33□□□□□ -0.63e-9■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 YY1AP1-215ENST00000436865 2684 ntTSL 1 (best)10.69□□□□□ -0.73e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 CLIC1-210ENST00000616760 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.713e-9■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 YY1AP1-203ENST00000347088 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.773e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 APP-212ENST00000463070 582 ntTSL 29.19□□□□□ -0.942e-11■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 YY1AP1-225ENST00000496324 714 ntTSL 57.52□□□□□ -1.213e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.223e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 YY1AP1-224ENST00000493625 958 ntTSL 55.59□□□□□ -1.513e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 FADS1-213ENST00000539999 405 ntTSL 35.55□□□□□ -1.523e-9■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 YY1AP1-219ENST00000466366 374 ntTSL 54.02□□□□□ -1.773e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.213e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 SMG9-210ENST00000600097 538 ntTSL 218.76■□□□□ 0.593e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.79■□□□□ 0.443e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 SGSM3-207ENST00000469719 1029 ntTSL 517.08■□□□□ 0.323e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 SGSM3-202ENST00000417424 666 ntTSL 516.21■□□□□ 0.193e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.123e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.093e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 NUF2-201ENST00000271452 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.063e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -03e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 SGSM3-213ENST00000485962 2973 ntTSL 514.58□□□□□ -0.083e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 POLR3K-202ENST00000481810 907 ntTSL 214.48□□□□□ -0.093e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 AL022238.4-201ENST00000639722 4563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.153e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 SGSM3-209ENST00000478085 4218 ntTSL 213.3□□□□□ -0.283e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 TTC3-202ENST00000355666 7712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.63e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 RPLP0-220ENST00000551217 677 nt10.48□□□□□ -0.733e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 NPEPPS-216ENST00000530514 2092 ntTSL 29.71□□□□□ -0.853e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 TTC3-216ENST00000479930 8998 ntTSL 1 (best)9.71□□□□□ -0.853e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 NPEPPS-215ENST00000530173 2864 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.013e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.213e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 TTC3-215ENST00000476784 7425 ntTSL 27.12□□□□□ -1.273e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.323e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.373e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 ASNS-216ENST00000487714 689 ntTSL 26.12□□□□□ -1.432e-9■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.483e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 ADARB1-208ENST00000462214 587 ntTSL 38.93□□□□□ -0.981e-7■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 OS9-222ENST00000552787 962 ntTSL 217.21■□□□□ 0.354e-8■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 OS9-213ENST00000550372 503 ntTSL 416.14■□□□□ 0.174e-8■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 OS9-223ENST00000553208 1022 ntTSL 313.63□□□□□ -0.234e-8■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 OS9-217ENST00000550848 558 ntTSL 512.36□□□□□ -0.434e-8■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC4.04□□□□□ -1.761e-323■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 SERPINA1-204ENST00000402629 1450 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.341e-47■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.453e-10■□□□□ 8.4
NOLC1Q14978 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.363e-10■□□□□ 8.4
NOLC1Q14978 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.353e-10■□□□□ 8.4
NOLC1Q14978 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.183e-10■□□□□ 8.4
NOLC1Q14978 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.123e-10■□□□□ 8.4
NOLC1Q14978 HNRNPH1-218ENST00000510678 1996 ntTSL 515.25■□□□□ 0.033e-10■□□□□ 8.4
NOLC1Q14978 HNRNPH1-223ENST00000514332 2444 ntTSL 214.83□□□□□ -0.043e-10■□□□□ 8.4
NOLC1Q14978 HNRNPH1-206ENST00000502904 2913 ntTSL 211.52□□□□□ -0.573e-10■□□□□ 8.4
NOLC1Q14978 HNRNPH1-227ENST00000515481 5564 ntTSL 26.46□□□□□ -1.383e-10■□□□□ 8.4
NOLC1Q14978 ZBED3-203ENST00000511587 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 324.78■■□□□ 1.561e-323■□□□□ 8.4
NOLC1Q14978 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.291e-323■□□□□ 8.4
NOLC1Q14978 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC14.57□□□□□ -0.081e-323■□□□□ 8.4
NOLC1Q14978 ZBED3-202ENST00000505685 432 ntTSL 310.22□□□□□ -0.771e-323■□□□□ 8.4
NOLC1Q14978 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.652e-20■□□□□ 8.4
NOLC1Q14978 SLC39A14-209ENST00000520644 377 ntTSL 521.83■■□□□ 1.092e-20■□□□□ 8.4
NOLC1Q14978 SLC39A14-212ENST00000524285 570 ntTSL 419.4■□□□□ 0.72e-20■□□□□ 8.4
NOLC1Q14978 SLC39A14-206ENST00000517552 576 ntTSL 318.68■□□□□ 0.582e-20■□□□□ 8.4
NOLC1Q14978 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.12e-20■□□□□ 8.4
NOLC1Q14978 SLC39A14-204ENST00000381237 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.052e-20■□□□□ 8.4
NOLC1Q14978 SLC39A14-203ENST00000359741 4641 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.222e-20■□□□□ 8.4
NOLC1Q14978 SLC39A14-211ENST00000522881 560 ntTSL 513.36□□□□□ -0.272e-20■□□□□ 8.4
NOLC1Q14978 SLC39A14-208ENST00000519960 467 ntTSL 48.01□□□□□ -1.132e-20■□□□□ 8.4
NOLC1Q14978 AL662899.3-203ENST00000409691 1903 ntTSL 315.82■□□□□ 0.123e-9■□□□□ 8.4
NOLC1Q14978 AL662899.3-201ENST00000375880 2487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.243e-9■□□□□ 8.4
NOLC1Q14978 LY6G5B-207ENST00000375864 2654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.243e-9■□□□□ 8.4
NOLC1Q14978 LY6G5B-209ENST00000471088 677 ntTSL 513.22□□□□□ -0.293e-9■□□□□ 8.4
NOLC1Q14978 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.116e-7■□□□□ 8.4
NOLC1Q14978 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.186e-7■□□□□ 8.4
NOLC1Q14978 TOMM20-201ENST00000366607 3387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.196e-7■□□□□ 8.4
NOLC1Q14978 RPL35A-206ENST00000464167 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.226e-7■□□□□ 8.4
NOLC1Q14978 MAGEC2-201ENST00000247452 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.336e-7■□□□□ 8.4
NOLC1Q14978 RPL35A-208ENST00000485439 677 ntTSL 28.53□□□□□ -1.046e-7■□□□□ 8.4
NOLC1Q14978 RPL35A-209ENST00000496582 579 ntTSL 27.65□□□□□ -1.186e-7■□□□□ 8.4
NOLC1Q14978 RPL35A-203ENST00000439255 564 ntTSL 57.38□□□□□ -1.236e-7■□□□□ 8.4
NOLC1Q14978 RPL35A-202ENST00000429437 442 ntTSL 56.18□□□□□ -1.426e-7■□□□□ 8.4
NOLC1Q14978 RPL35A-201ENST00000329092 456 ntTSL 36.14□□□□□ -1.436e-7■□□□□ 8.4
NOLC1Q14978 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.526e-7■□□□□ 8.4
NOLC1Q14978 RPL35A-204ENST00000442341 517 ntTSL 35.31□□□□□ -1.566e-7■□□□□ 8.4
NOLC1Q14978 POR-217ENST00000460892 603 ntTSL 214.73□□□□□ -0.052e-14■□□□□ 8.4
NOLC1Q14978 CFB-278ENST00000472581 1059 ntTSL 216.88■□□□□ 0.295e-12■□□□□ 8.3
NOLC1Q14978 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.467e-11■□□□□ 8.3
NOLC1Q14978 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.097e-11■□□□□ 8.3
NOLC1Q14978 SERPINF2-204ENST00000453066 842 ntTSL 518.92■□□□□ 0.627e-11■□□□□ 8.3
NOLC1Q14978 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.597e-11■□□□□ 8.3
NOLC1Q14978 SERPINF2-205ENST00000453723 838 ntTSL 316.4■□□□□ 0.227e-11■□□□□ 8.3
NOLC1Q14978 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.351e-7■□□□□ 8.3
NOLC1Q14978 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.181e-7■□□□□ 8.3
NOLC1Q14978 CD53-205ENST00000497404 917 ntTSL 54.93□□□□□ -1.621e-7■□□□□ 8.3
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