RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505685.1

ZBED3-202, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene ZBED3, Length 432 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-202ENST00000505685 NISCHQ9Y2I1 1504 aa22.52■■□□□ 1.2
ZBED3-202ENST00000505685 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
ZBED3-202ENST00000505685 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.14■□□□□ 0.81
ZBED3-202ENST00000505685 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa20.01■□□□□ 0.79
ZBED3-202ENST00000505685 ABCC9O60706 1549 aa19.53■□□□□ 0.72
ZBED3-202ENST00000505685 NACADO15069 1562 aa18.85■□□□□ 0.61
ZBED3-202ENST00000505685 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa18.85■□□□□ 0.61
ZBED3-202ENST00000505685 DCAF8L2P0C7V8 631 aa18.81■□□□□ 0.6
ZBED3-202ENST00000505685 MYO15BQ96JP2 1530 aa18.8■□□□□ 0.6
ZBED3-202ENST00000505685 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
ZBED3-202ENST00000505685 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa18.69■□□□□ 0.58
ZBED3-202ENST00000505685 UNC13AQ9UPW8 1703 aa18.27■□□□□ 0.52
ZBED3-202ENST00000505685 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP18.26■□□□□ 0.51
ZBED3-202ENST00000505685 BICRAQ9NZM4 1560 aa18.21■□□□□ 0.51
ZBED3-202ENST00000505685 SCRIBQ14160 1630 aa18.19■□□□□ 0.5
ZBED3-202ENST00000505685 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa18.18■□□□□ 0.5
ZBED3-202ENST00000505685 DNAJC5BQ9UF47 199 aa17.9■□□□□ 0.46
ZBED3-202ENST00000505685 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
ZBED3-202ENST00000505685 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
ZBED3-202ENST00000505685 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
ZBED3-202ENST00000505685 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa17.66■□□□□ 0.42
ZBED3-202ENST00000505685 CECR2Q9BXF3 1484 aa17.59■□□□□ 0.41
ZBED3-202ENST00000505685 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
ZBED3-202ENST00000505685 SMARCA4P51532 1647 aa17.44■□□□□ 0.38
ZBED3-202ENST00000505685 NCAPD3P42695 1498 aa17.41■□□□□ 0.38
ZBED3-202ENST00000505685 SMARCA2P51531 1590 aa17.4■□□□□ 0.38
ZBED3-202ENST00000505685 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa17.38■□□□□ 0.37
ZBED3-202ENST00000505685 PEG3Q9GZU2 1588 aa17.32■□□□□ 0.36
ZBED3-202ENST00000505685 MROH2BQ7Z745 1585 aa17.31■□□□□ 0.36
ZBED3-202ENST00000505685 HMGXB3Q12766 1538 aa17.3■□□□□ 0.36
ZBED3-202ENST00000505685 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
ZBED3-202ENST00000505685 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
ZBED3-202ENST00000505685 WIZO95785 1651 aa17.08■□□□□ 0.32
ZBED3-202ENST00000505685 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
ZBED3-202ENST00000505685 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa16.92■□□□□ 0.3
ZBED3-202ENST00000505685 CADPSQ9ULU8 1353 aa16.9■□□□□ 0.3
ZBED3-202ENST00000505685 ERCC6Q03468 1493 aa16.89■□□□□ 0.29
ZBED3-202ENST00000505685 NESP48681 1621 aa16.87■□□□□ 0.29
ZBED3-202ENST00000505685 PDS5BQ9NTI5 1447 aa16.87■□□□□ 0.29
ZBED3-202ENST00000505685 CFTRP13569 1480 aa16.79■□□□□ 0.28
ZBED3-202ENST00000505685 CCDC88BA6NC98 1476 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED3-202ENST00000505685 CUX2O14529 1486 aa16.73■□□□□ 0.27
ZBED3-202ENST00000505685 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
ZBED3-202ENST00000505685 FANCD2Q9BXW9 1451 aa16.67■□□□□ 0.26
ZBED3-202ENST00000505685 CEP164Q9UPV0 1460 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED3-202ENST00000505685 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa16.64■□□□□ 0.25
ZBED3-202ENST00000505685 MRC2Q9UBG0 1479 aa16.63■□□□□ 0.25
ZBED3-202ENST00000505685 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
ZBED3-202ENST00000505685 FOXD1Q16676 465 aa16.58■□□□□ 0.24
ZBED3-202ENST00000505685 PRDM2Q13029 1718 aa16.56■□□□□ 0.24
ZBED3-202ENST00000505685 WDR62O43379 1518 aa16.55■□□□□ 0.24
ZBED3-202ENST00000505685 ABCC8Q09428 1581 aa16.49■□□□□ 0.23
ZBED3-202ENST00000505685 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
ZBED3-202ENST00000505685 TOPBP1Q92547 1522 aa16.4■□□□□ 0.22
ZBED3-202ENST00000505685 DNMBPQ6XZF7 1577 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED3-202ENST00000505685 IFT140Q96RY7 1462 aa16.34■□□□□ 0.21
ZBED3-202ENST00000505685 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
ZBED3-202ENST00000505685 CUX1P39880 1505 aa16.24■□□□□ 0.19
ZBED3-202ENST00000505685 SOGA1O94964 1423 aa16.22■□□□□ 0.19
ZBED3-202ENST00000505685 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa16.21■□□□□ 0.19
ZBED3-202ENST00000505685 FGD5Q6ZNL6 1462 aa16.21■□□□□ 0.19
ZBED3-202ENST00000505685 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP16.2■□□□□ 0.18
ZBED3-202ENST00000505685 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
ZBED3-202ENST00000505685 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
ZBED3-202ENST00000505685 PLPPR3Q6T4P5 718 aa16.15■□□□□ 0.18
ZBED3-202ENST00000505685 WDR97A6NE52 1622 aa16.15■□□□□ 0.18
ZBED3-202ENST00000505685 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa16.15■□□□□ 0.18
ZBED3-202ENST00000505685 TOP2BQ02880 1626 aa16.13■□□□□ 0.17
ZBED3-202ENST00000505685 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP16.11■□□□□ 0.17not detected■■■■■ 30.5
ZBED3-202ENST00000505685 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
ZBED3-202ENST00000505685 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa16.1■□□□□ 0.17
ZBED3-202ENST00000505685 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
ZBED3-202ENST00000505685 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa16.09■□□□□ 0.17
ZBED3-202ENST00000505685 SYNJ1O43426 1573 aa16.08■□□□□ 0.16
ZBED3-202ENST00000505685 OSCARQ8IYS5 282 aa16.07■□□□□ 0.16
ZBED3-202ENST00000505685 GRIN2BQ13224 1484 aa16.04■□□□□ 0.16
ZBED3-202ENST00000505685 POTEDQ86YR6 584 aa16.03■□□□□ 0.16
ZBED3-202ENST00000505685 GAPVD1Q14C86 1478 aa16.03■□□□□ 0.16
ZBED3-202ENST00000505685 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
ZBED3-202ENST00000505685 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa15.97■□□□□ 0.15
ZBED3-202ENST00000505685 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.97■□□□□ 0.15
ZBED3-202ENST00000505685 FBLN2P98095 1184 aa15.95■□□□□ 0.14
ZBED3-202ENST00000505685 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
ZBED3-202ENST00000505685 SYNJ2O15056 1496 aa15.92■□□□□ 0.14
ZBED3-202ENST00000505685 ERICH3Q5RHP9 1530 aa15.91■□□□□ 0.14
ZBED3-202ENST00000505685 KIF27Q86VH2 1401 aa15.9■□□□□ 0.14
ZBED3-202ENST00000505685 PBRM1Q86U86 1689 aa15.89■□□□□ 0.13
ZBED3-202ENST00000505685 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.87■□□□□ 0.13
ZBED3-202ENST00000505685 TRIM41Q8WV44 630 aa15.86■□□□□ 0.13
ZBED3-202ENST00000505685 CHD1O14646 1710 aa15.85■□□□□ 0.13
ZBED3-202ENST00000505685 ADAMTS12P58397 1594 aa15.82■□□□□ 0.12
ZBED3-202ENST00000505685 IGF1RP08069 1367 aa15.81■□□□□ 0.12
ZBED3-202ENST00000505685 GRIN2AQ12879 1464 aa15.8■□□□□ 0.12
ZBED3-202ENST00000505685 PPP6R1Q9UPN7 881 aa15.8■□□□□ 0.12
ZBED3-202ENST00000505685 NUP160Q12769 1436 aa15.76■□□□□ 0.11
ZBED3-202ENST00000505685 CLASP1Q7Z460 1538 aa15.75■□□□□ 0.11
ZBED3-202ENST00000505685 ADRA2BP18089 450 aa15.75■□□□□ 0.11
ZBED3-202ENST00000505685 CUL7Q14999 1698 aa15.73■□□□□ 0.11
ZBED3-202ENST00000505685 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa15.73■□□□□ 0.11
ZBED3-202ENST00000505685 ARHGEF11O15085 1522 aa15.73■□□□□ 0.11
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