RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511587.1

ZBED3-203, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ZBED3, Length 542 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-203ENST00000511587 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.55■■■■■ 6.64
ZBED3-203ENST00000511587 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.64■■■■■ 5.7
ZBED3-203ENST00000511587 ABCC9O60706 1549 aa50.19■■■■■ 5.62
ZBED3-203ENST00000511587 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.97■■■■■ 5.27
ZBED3-203ENST00000511587 NACADO15069 1562 aa47.75■■■■■ 5.23
ZBED3-203ENST00000511587 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.35■■■■■ 5.17
ZBED3-203ENST00000511587 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.27■■■■■ 5.16
ZBED3-203ENST00000511587 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.98■■■■■ 5.11
ZBED3-203ENST00000511587 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.95■■■■■ 5.11
ZBED3-203ENST00000511587 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.79■■■■■ 5.08
ZBED3-203ENST00000511587 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.76■■■■■ 5.08
ZBED3-203ENST00000511587 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.72■■■■■ 5.07
ZBED3-203ENST00000511587 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.62■■■■■ 5.05
ZBED3-203ENST00000511587 SCRIBQ14160 1630 aa46.09■■■■■ 4.97
ZBED3-203ENST00000511587 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.04■■■■■ 4.96
ZBED3-203ENST00000511587 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.41■■■■■ 4.86
ZBED3-203ENST00000511587 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.41■■■■■ 4.86
ZBED3-203ENST00000511587 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.18■■■■■ 4.82
ZBED3-203ENST00000511587 NCAPD3P42695 1498 aa44.08■■■■■ 4.65
ZBED3-203ENST00000511587 SMARCA4P51532 1647 aa44.05■■■■■ 4.64
ZBED3-203ENST00000511587 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.98■■■■■ 4.63
ZBED3-203ENST00000511587 SMARCA2P51531 1590 aa43.88■■■■■ 4.61
ZBED3-203ENST00000511587 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.87■■■■■ 4.61
ZBED3-203ENST00000511587 HMGXB3Q12766 1538 aa43.81■■■■■ 4.6
ZBED3-203ENST00000511587 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.67■■■■■ 4.58
ZBED3-203ENST00000511587 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.58■■■■■ 4.57
ZBED3-203ENST00000511587 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.55■■■■■ 4.56
ZBED3-203ENST00000511587 ERCC6Q03468 1493 aa43.27■■■■■ 4.52
ZBED3-203ENST00000511587 NESP48681 1621 aa43.24■■■■■ 4.51
ZBED3-203ENST00000511587 CUX2O14529 1486 aa43.15■■■■■ 4.5
ZBED3-203ENST00000511587 WIZO95785 1651 aa43.06■■■■■ 4.48
ZBED3-203ENST00000511587 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.03■■■■■ 4.48
ZBED3-203ENST00000511587 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.81■■■■■ 4.44
ZBED3-203ENST00000511587 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.79■■■■■ 4.44
ZBED3-203ENST00000511587 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.73■■■■■ 4.43
ZBED3-203ENST00000511587 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.71■■■■■ 4.43
ZBED3-203ENST00000511587 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.71■■■■■ 4.43
ZBED3-203ENST00000511587 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.66■■■■■ 4.42
ZBED3-203ENST00000511587 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.56■■■■■ 4.4
ZBED3-203ENST00000511587 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.36■■■■■ 4.37
ZBED3-203ENST00000511587 CFTRP13569 1480 aa42.34■■■■■ 4.37
ZBED3-203ENST00000511587 WDR62O43379 1518 aa42.29■■■■■ 4.36
ZBED3-203ENST00000511587 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.24■■■■■ 4.35
ZBED3-203ENST00000511587 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.23■■■■■ 4.35
ZBED3-203ENST00000511587 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.04■■■■■ 4.32
ZBED3-203ENST00000511587 PRDM2Q13029 1718 aa41.99■■■■■ 4.31
ZBED3-203ENST00000511587 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.9■■■■■ 4.3
ZBED3-203ENST00000511587 TOPBP1Q92547 1522 aa41.49■■■■■ 4.23
ZBED3-203ENST00000511587 ABCC8Q09428 1581 aa41.41■■■■■ 4.22
ZBED3-203ENST00000511587 IFT140Q96RY7 1462 aa41.4■■■■■ 4.22
ZBED3-203ENST00000511587 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.39■■■■■ 4.22
ZBED3-203ENST00000511587 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.3■■■■■ 4.2
ZBED3-203ENST00000511587 OSCARQ8IYS5 282 aa41.14■■■■■ 4.18
ZBED3-203ENST00000511587 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.14■■■■■ 4.18
ZBED3-203ENST00000511587 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.12■■■■■ 4.17
ZBED3-203ENST00000511587 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.09■■■■■ 4.17
ZBED3-203ENST00000511587 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41■■■■■ 4.15
ZBED3-203ENST00000511587 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.94■■■■■ 4.14not detected■■■■■ 30.5
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ZBED3-203ENST00000511587 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.91■■■■■ 4.14
ZBED3-203ENST00000511587 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.88■■■■■ 4.13
ZBED3-203ENST00000511587 SOGA1O94964 1423 aa40.85■■■■■ 4.13
ZBED3-203ENST00000511587 TRIM41Q8WV44 630 aa40.85■■■■■ 4.13
ZBED3-203ENST00000511587 WDR97A6NE52 1622 aa40.75■■■■■ 4.11
ZBED3-203ENST00000511587 CHD1O14646 1710 aa40.74■■■■■ 4.11
ZBED3-203ENST00000511587 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.73■■■■■ 4.11
ZBED3-203ENST00000511587 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.67■■■■■ 4.1
ZBED3-203ENST00000511587 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.67■■■■■ 4.1
ZBED3-203ENST00000511587 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.67■■■■■ 4.1
ZBED3-203ENST00000511587 ARHGEF11O15085 1522 aa40.57■■■■■ 4.09
ZBED3-203ENST00000511587 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.56■■■■■ 4.08
ZBED3-203ENST00000511587 GRIN2BQ13224 1484 aa40.5■■■■■ 4.07
ZBED3-203ENST00000511587 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.48■■■■■ 4.07
ZBED3-203ENST00000511587 FBLN2P98095 1184 aa40.48■■■■■ 4.07
ZBED3-203ENST00000511587 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.47■■■■■ 4.07
ZBED3-203ENST00000511587 PBRM1Q86U86 1689 aa40.4■■■■■ 4.06
ZBED3-203ENST00000511587 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.4■■■■■ 4.06
ZBED3-203ENST00000511587 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.39■■■■■ 4.06
ZBED3-203ENST00000511587 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.39■■■■■ 4.06
ZBED3-203ENST00000511587 TOP2BQ02880 1626 aa40.37■■■■■ 4.05
ZBED3-203ENST00000511587 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.33■■■■■ 4.05
ZBED3-203ENST00000511587 SYNJ2O15056 1496 aa40.33■■■■■ 4.05
ZBED3-203ENST00000511587 SYNJ1O43426 1573 aa40.33■■■■■ 4.05
ZBED3-203ENST00000511587 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.32■■■■■ 4.04
ZBED3-203ENST00000511587 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.28■■■■■ 4.04
ZBED3-203ENST00000511587 ARAP1Q96P48 1450 aa40.2■■■■■ 4.03
ZBED3-203ENST00000511587 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.13■■■■■ 4.01
ZBED3-203ENST00000511587 ADAMTS12P58397 1594 aa40.06■■■■■ 4
ZBED3-203ENST00000511587 GRIN2AQ12879 1464 aa40■■■■□ 3.99
ZBED3-203ENST00000511587 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.96■■■■□ 3.99
ZBED3-203ENST00000511587 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.91■■■■□ 3.98
ZBED3-203ENST00000511587 NUP160Q12769 1436 aa39.88■■■■□ 3.97
ZBED3-203ENST00000511587 CEP170Q5SW79 1584 aa39.86■■■■□ 3.97
ZBED3-203ENST00000511587 SHROOM2Q13796 1616 aa39.69■■■■□ 3.94
ZBED3-203ENST00000511587 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.68■■■■□ 3.94
ZBED3-203ENST00000511587 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.53■■■■□ 3.92
ZBED3-203ENST00000511587 KIF27Q86VH2 1401 aa39.53■■■■□ 3.92
ZBED3-203ENST00000511587 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.49■■■■□ 3.91
ZBED3-203ENST00000511587 IGF1RP08069 1367 aa39.48■■■■□ 3.91
ZBED3-203ENST00000511587 CUL7Q14999 1698 aa39.45■■■■□ 3.91
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