Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 GGA2-204ENST00000563047 366 ntTSL 521.15■□□□□ 0.981e-9■■■□□ 18.2
ILF3Q12906 GGA2-212ENST00000568799 1403 ntTSL 521.06■□□□□ 0.961e-9■■■□□ 18.2
ILF3Q12906 GGA2-205ENST00000563494 553 ntTSL 520.9■□□□□ 0.941e-9■■■□□ 18.2
ILF3Q12906 UQCC1-219ENST00000491125 990 ntTSL 515.87■□□□□ 0.131e-9■■■□□ 18.2
ILF3Q12906 GGA2-202ENST00000562117 387 ntTSL 512.92□□□□□ -0.341e-9■■■□□ 18.2
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ILF3Q12906 UQCC1-207ENST00000397553 566 ntTSL 58.6□□□□□ -1.031e-9■■■□□ 18.2
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ILF3Q12906 RBM39-243ENST00000528062 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.482e-7■■■□□ 18.1
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ILF3Q12906 RBM39-202ENST00000338163 2792 ntTSL 210.8□□□□□ -0.682e-7■■■□□ 18.1
ILF3Q12906 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.852e-7■■■□□ 18.1
ILF3Q12906 RBM39-221ENST00000461283 2415 ntTSL 52.83□□□□□ -1.962e-7■■■□□ 18.1
ILF3Q12906 YIF1B-208ENST00000587361 579 ntTSL 322.87■■□□□ 1.253e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.053e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.833e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 YIF1B-212ENST00000589644 1917 ntTSL 218.36■□□□□ 0.533e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 YIF1B-205ENST00000585563 1118 ntTSL 317.73■□□□□ 0.433e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.33e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.213e-6■■■□□ 18
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ILF3Q12906 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.073e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.023e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 YIF1B-211ENST00000589247 734 ntTSL 214.63□□□□□ -0.073e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 FARP1-231ENST00000600648 433 ntTSL 521.52■■□□□ 1.041e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 PACSIN2-210ENST00000453643 818 ntTSL 515.92■□□□□ 0.144e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.124e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 PACSIN2-208ENST00000445706 511 ntTSL 511.7□□□□□ -0.544e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 ZMYND8-214ENST00000467200 3634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)8.84□□□□□ -0.997e-8■■■□□ 18
ILF3Q12906 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.071e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 UHRF1BP1-201ENST00000192788 9570 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.931e-6■■■□□ 18
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