Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms