Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SSBP2P81877 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SSBP2P81877 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SSBP2P81877 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SSBP2P81877 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SSBP2P81877 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
SSBP2P81877 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP2P81877 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms