Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSNK1EP49674 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms