Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL35P42766 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL35P42766 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL35P42766 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL35P42766 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL35P42766 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL35P42766 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL35P42766 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL35P42766 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL35P42766 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL35P42766 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL35P42766 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL35P42766 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL35P42766 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL35P42766 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL35P42766 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL35P42766 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL35P42766 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL35P42766 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL35P42766 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL35P42766 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL35P42766 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL35P42766 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL35P42766 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL35P42766 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL35P42766 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL35P42766 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL35P42766 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL35P42766 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL35P42766 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL35P42766 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL35P42766 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL35P42766 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL35P42766 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL35P42766 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL35P42766 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL35P42766 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL35P42766 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL35P42766 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL35P42766 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL35P42766 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPL35P42766 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPL35P42766 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPL35P42766 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPL35P42766 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPL35P42766 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL35P42766 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL35P42766 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL35P42766 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL35P42766 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL35P42766 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL35P42766 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL35P42766 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL35P42766 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL35P42766 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL35P42766 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL35P42766 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL35P42766 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL35P42766 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL35P42766 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL35P42766 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL35P42766 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL35P42766 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL35P42766 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL35P42766 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL35P42766 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL35P42766 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL35P42766 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL35P42766 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL35P42766 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL35P42766 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL35P42766 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL35P42766 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL35P42766 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL35P42766 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL35P42766 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL35P42766 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL35P42766 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL35P42766 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL35P42766 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL35P42766 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL35P42766 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL35P42766 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL35P42766 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL35P42766 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL35P42766 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL35P42766 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL35P42766 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL35P42766 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL35P42766 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL35P42766 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL35P42766 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL35P42766 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL35P42766 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL35P42766 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL35P42766 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL35P42766 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL35P42766 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL35P42766 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL35P42766 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms