Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV44

LINC00846, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00846, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00846Q9NV44 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00846Q9NV44 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms