Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms