Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF8Q3BBV2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms