Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

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Length 68 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NREPQ16612 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NREPQ16612 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NREPQ16612 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NREPQ16612 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NREPQ16612 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NREPQ16612 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NREPQ16612 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NREPQ16612 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NREPQ16612 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NREPQ16612 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NREPQ16612 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NREPQ16612 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NREPQ16612 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NREPQ16612 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NREPQ16612 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NREPQ16612 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NREPQ16612 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NREPQ16612 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NREPQ16612 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NREPQ16612 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NREPQ16612 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NREPQ16612 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NREPQ16612 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
NREPQ16612 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NREPQ16612 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NREPQ16612 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NREPQ16612 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NREPQ16612 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NREPQ16612 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NREPQ16612 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NREPQ16612 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NREPQ16612 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NREPQ16612 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NREPQ16612 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NREPQ16612 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NREPQ16612 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NREPQ16612 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NREPQ16612 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NREPQ16612 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NREPQ16612 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NREPQ16612 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NREPQ16612 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NREPQ16612 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NREPQ16612 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NREPQ16612 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NREPQ16612 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NREPQ16612 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
NREPQ16612 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
NREPQ16612 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NREPQ16612 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NREPQ16612 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NREPQ16612 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NREPQ16612 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NREPQ16612 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NREPQ16612 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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NREPQ16612 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NREPQ16612 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
NREPQ16612 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NREPQ16612 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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NREPQ16612 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NREPQ16612 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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NREPQ16612 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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NREPQ16612 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NREPQ16612 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NREPQ16612 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NREPQ16612 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NREPQ16612 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NREPQ16612 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NREPQ16612 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NREPQ16612 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NREPQ16612 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NREPQ16612 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NREPQ16612 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NREPQ16612 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NREPQ16612 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NREPQ16612 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NREPQ16612 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NREPQ16612 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NREPQ16612 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NREPQ16612 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NREPQ16612 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NREPQ16612 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NREPQ16612 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NREPQ16612 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NREPQ16612 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NREPQ16612 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NREPQ16612 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NREPQ16612 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NREPQ16612 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NREPQ16612 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NREPQ16612 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NREPQ16612 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NREPQ16612 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NREPQ16612 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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