Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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