Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 DGAT1-204ENST00000525371 840 ntTSL 519.2■□□□□ 0.661e-6■■■■■ 37.8
EFTUD2Q15029 RIPOR1-210ENST00000565176 562 ntTSL 416.81■□□□□ 0.282e-7■■■■■ 37.8
EFTUD2Q15029 POLG-210ENST00000532363 445 ntTSL 211.68□□□□□ -0.548e-7■■■■■ 37.8
EFTUD2Q15029 ARL8A-202ENST00000486225 431 ntTSL 315.12■□□□□ 0.015e-7■■■■■ 37.8
EFTUD2Q15029 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.271e-6■■■■■ 37.8
EFTUD2Q15029 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.031e-6■■■■■ 37.8
EFTUD2Q15029 RGS3-203ENST00000343817 3689 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.521e-6■■■■■ 37.8
EFTUD2Q15029 NCLN-203ENST00000587740 1210 ntTSL 1 (best)15.07■□□□□ 08e-7■■■■■ 37.8
EFTUD2Q15029 MRPL38-207ENST00000477023 446 ntTSL 310.56□□□□□ -0.723e-7■■■■■ 37.8
EFTUD2Q15029 PLXND1-211ENST00000506979 691 ntTSL 58.78□□□□□ -14e-8■■■■■ 37.8
EFTUD2Q15029 PRKCSH-202ENST00000585540 501 ntTSL 313.31□□□□□ -0.283e-8■■■■■ 37.8
EFTUD2Q15029 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.142e-7■■■■■ 37.8
EFTUD2Q15029 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.072e-7■■■■■ 37.8
EFTUD2Q15029 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.962e-7■■■■■ 37.8
EFTUD2Q15029 CTU2-208ENST00000566637 1619 ntTSL 220.84■□□□□ 0.932e-7■■■■■ 37.8
EFTUD2Q15029 CTU2-204ENST00000564105 1586 ntTSL 1 (best)19.04■□□□□ 0.642e-7■■■■■ 37.8
EFTUD2Q15029 SPAG5-201ENST00000321765 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.374e-7■■■■■ 37.8
EFTUD2Q15029 MTA1-213ENST00000490198 814 ntTSL 318.95■□□□□ 0.628e-7■■■■■ 37.7
EFTUD2Q15029 UBA52-214ENST00000599595 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.373e-7■■■■■ 37.7
EFTUD2Q15029 UBA52-213ENST00000599551 707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.684e-7■■■■■ 37.7
EFTUD2Q15029 UBA52-203ENST00000594527 357 ntTSL 35.66□□□□□ -1.53e-7■■■■■ 37.7
EFTUD2Q15029 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.624e-7■■■■■ 37.7
EFTUD2Q15029 UBA52-206ENST00000596272 508 ntTSL 24.82□□□□□ -1.643e-7■■■■■ 37.7
EFTUD2Q15029 PHLDB1-213ENST00000527898 2921 ntTSL 216.26■□□□□ 0.194e-6■■■■■ 37.7
EFTUD2Q15029 PHLDB1-222ENST00000534140 3128 ntTSL 216.2■□□□□ 0.184e-6■■■■■ 37.7
EFTUD2Q15029 PHLDB1-220ENST00000532517 5242 ntTSL 1 (best)15.9■□□□□ 0.144e-6■■■■■ 37.7
EFTUD2Q15029 PHLDB1-225ENST00000614369 3442 ntTSL 1 (best)14.98□□□□□ -0.014e-6■■■■■ 37.7
EFTUD2Q15029 PHLDB1-215ENST00000528875 548 ntTSL 414.65□□□□□ -0.064e-6■■■■■ 37.7
EFTUD2Q15029 PHLDB1-203ENST00000392852 3191 ntTSL 212.09□□□□□ -0.474e-6■■■■■ 37.7
EFTUD2Q15029 ARFGAP2-204ENST00000524727 995 ntTSL 214.91□□□□□ -0.023e-7■■■■■ 37.7
EFTUD2Q15029 ARFGAP2-217ENST00000528444 730 ntTSL 513.26□□□□□ -0.293e-7■■■■■ 37.7
EFTUD2Q15029 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.012e-9■■■■■ 37.7
EFTUD2Q15029 HSPA8-214ENST00000531063 578 ntTSL 23□□□□□ -1.931e-12■■■■■ 37.7
EFTUD2Q15029 HSPA8-204ENST00000524590 536 ntTSL 52.74□□□□□ -1.971e-12■■■■■ 37.7
EFTUD2Q15029 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 37.7
EFTUD2Q15029 IMP4-208ENST00000460766 2379 ntTSL 1 (best)21.48■■□□□ 1.038e-7■■■■■ 37.7
EFTUD2Q15029 IMP4-210ENST00000462392 1793 ntTSL 320.91■□□□□ 0.948e-7■■■■■ 37.7
EFTUD2Q15029 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.478e-7■■■■■ 37.7
EFTUD2Q15029 IMP4-211ENST00000464432 939 ntTSL 516.58■□□□□ 0.248e-7■■■■■ 37.7
EFTUD2Q15029 IMP4-202ENST00000409649 822 ntTSL 216.37■□□□□ 0.218e-7■■■■■ 37.7
EFTUD2Q15029 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.128e-7■■■■■ 37.7
EFTUD2Q15029 IMP4-204ENST00000428740 924 ntTSL 314.09□□□□□ -0.158e-7■■■■■ 37.7
EFTUD2Q15029 IPO13-202ENST00000372343 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.464e-8■■■■■ 37.7
EFTUD2Q15029 ARHGEF1-213ENST00000595897 2973 ntTSL 1 (best)18.32■□□□□ 0.521e-7■■■■■ 37.7
EFTUD2Q15029 TFDP1-208ENST00000544902 1571 ntTSL 221.66■■□□□ 1.063e-6■■■■■ 37.7
EFTUD2Q15029 NSFL1C-207ENST00000478168 624 ntTSL 219.49■□□□□ 0.719e-9■■■■■ 37.7
EFTUD2Q15029 NSFL1C-211ENST00000555359 450 ntTSL 319.49■□□□□ 0.719e-9■■■■■ 37.7
EFTUD2Q15029 NSFL1C-208ENST00000487086 456 ntTSL 216.12■□□□□ 0.179e-9■■■■■ 37.7
EFTUD2Q15029 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.033e-6■■■■■ 37.7
EFTUD2Q15029 ROGDI-216ENST00000592112 968 ntTSL 222.31■■□□□ 1.167e-7■■■■■ 37.7
EFTUD2Q15029 TBL3-207ENST00000569792 856 ntTSL 513.98□□□□□ -0.171e-6■■■■■ 37.7
EFTUD2Q15029 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.781e-7■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.241e-7■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 FAH-208ENST00000558767 2087 ntTSL 222.45■■□□□ 1.181e-6■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 FAH-203ENST00000537726 1396 ntTSL 219.48■□□□□ 0.711e-6■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.121e-6■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 FAH-212ENST00000561369 746 ntTSL 314.6□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 FAH-205ENST00000558022 568 ntTSL 414.03□□□□□ -0.161e-6■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 FAH-207ENST00000558627 842 ntTSL 57.6□□□□□ -1.191e-6■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 BMP4-209ENST00000609748 458 nt17.5■□□□□ 0.395e-17■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 BMP4-204ENST00000558961 495 ntTSL 310.7□□□□□ -0.75e-17■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 DECR2-203ENST00000429116 721 ntTSL 316.24■□□□□ 0.191e-6■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 DECR2-209ENST00000461947 1017 ntTSL 515.11■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 UBXN1-212ENST00000531625 542 ntTSL 217.97■□□□□ 0.476e-9■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 NT5DC2-206ENST00000466112 887 ntTSL 217.01■□□□□ 0.311e-6■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.512e-7■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.022e-7■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 RILPL1-201ENST00000340724 2389 ntTSL 514.87□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 EMC9-205ENST00000559101 530 ntTSL 35.12□□□□□ -1.593e-9■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.185e-8■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 LRRD1-202ENST00000422722 3511 ntTSL 212.47□□□□□ -0.415e-8■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.375e-8■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 CYP51A1-203ENST00000435873 556 ntTSL 43.37□□□□□ -1.875e-8■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 HSPA8-218ENST00000532636 2306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.611e-13■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 CES2-209ENST00000567128 440 ntTSL 211.76□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 LRPAP1-203ENST00000509198 1170 ntTSL 218.68■□□□□ 0.588e-7■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 PHRF1-204ENST00000532550 748 ntTSL 316.23■□□□□ 0.193e-7■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 CPNE1-212ENST00000430570 1332 ntTSL 524.51■■□□□ 1.514e-8■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 CPNE1-207ENST00000414664 1070 ntTSL 524.27■■□□□ 1.484e-8■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 CPNE1-217ENST00000439669 784 ntTSL 522.89■■□□□ 1.254e-8■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 CPNE1-211ENST00000420363 821 ntTSL 220.4■□□□□ 0.864e-8■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 CPNE1-213ENST00000434795 831 ntTSL 316.71■□□□□ 0.274e-8■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 CPNE1-210ENST00000416778 744 ntTSL 216.71■□□□□ 0.274e-8■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 CPNE1-206ENST00000412056 998 ntTSL 313.6□□□□□ -0.234e-8■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 CPNE1-218ENST00000439806 748 ntTSL 510.85□□□□□ -0.674e-8■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 CPNE1-226ENST00000486021 506 ntTSL 27.06□□□□□ -1.289e-17■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.538e-10■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 RBCK1-205ENST00000400245 1024 ntTSL 318.09■□□□□ 0.498e-10■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.298e-10■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 RBCK1-210ENST00000441733 961 ntTSL 516.87■□□□□ 0.298e-10■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 RBCK1-207ENST00000411647 593 ntTSL 39.31□□□□□ -0.928e-10■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 PIEZO1-213ENST00000518793 660 ntTSL 311.12□□□□□ -0.637e-7■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 HDAC5-206ENST00000587776 917 ntTSL 314.04□□□□□ -0.162e-9■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.039e-7■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.89e-7■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.749e-7■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.699e-7■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.49e-7■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.279e-7■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.269e-7■■■■■ 37.6
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