RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564105.5

CTU2-204, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTU2, Length 1,586 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-204ENST00000564105 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.08■■■■■ 4.81
CTU2-204ENST00000564105 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.83■■■■□ 3.97
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CTU2-204ENST00000564105 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.72■■■■□ 3.63
CTU2-204ENST00000564105 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.34■■■■□ 3.57
CTU2-204ENST00000564105 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.31■■■■□ 3.56
CTU2-204ENST00000564105 NACADO15069 1562 aa37.17■■■■□ 3.54
CTU2-204ENST00000564105 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.15■■■■□ 3.54
CTU2-204ENST00000564105 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.14■■■■□ 3.54
CTU2-204ENST00000564105 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.45■■■■□ 3.43
CTU2-204ENST00000564105 SCRIBQ14160 1630 aa36.39■■■■□ 3.42
CTU2-204ENST00000564105 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.35■■■■□ 3.41
CTU2-204ENST00000564105 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.28■■■■□ 3.4
CTU2-204ENST00000564105 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.13■■■■□ 3.37
CTU2-204ENST00000564105 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.12■■■■□ 3.37
CTU2-204ENST00000564105 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.2■■■■□ 3.23
CTU2-204ENST00000564105 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
CTU2-204ENST00000564105 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.03■■■■□ 3.2
CTU2-204ENST00000564105 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.9■■■■□ 3.18
CTU2-204ENST00000564105 SMARCA4P51532 1647 aa34.88■■■■□ 3.17
CTU2-204ENST00000564105 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.77■■■■□ 3.16
CTU2-204ENST00000564105 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.61■■■■□ 3.13
CTU2-204ENST00000564105 WIZO95785 1651 aa34.54■■■■□ 3.12
CTU2-204ENST00000564105 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.47■■■■□ 3.11
CTU2-204ENST00000564105 SMARCA2P51531 1590 aa34.43■■■■□ 3.1
CTU2-204ENST00000564105 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.39■■■■□ 3.1
CTU2-204ENST00000564105 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.37■■■■□ 3.09
CTU2-204ENST00000564105 NCAPD3P42695 1498 aa34.23■■■■□ 3.07
CTU2-204ENST00000564105 HMGXB3Q12766 1538 aa34.19■■■■□ 3.06
CTU2-204ENST00000564105 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
CTU2-204ENST00000564105 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.13■■■■□ 3.05
CTU2-204ENST00000564105 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.7■■■□□ 2.99
CTU2-204ENST00000564105 NESP48681 1621 aa33.55■■■□□ 2.96
CTU2-204ENST00000564105 ERCC6Q03468 1493 aa33.54■■■□□ 2.96
CTU2-204ENST00000564105 CUX2O14529 1486 aa33.41■■■□□ 2.94
CTU2-204ENST00000564105 PRDM2Q13029 1718 aa33.36■■■□□ 2.93
CTU2-204ENST00000564105 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.31■■■□□ 2.92
CTU2-204ENST00000564105 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.27■■■□□ 2.92
CTU2-204ENST00000564105 CFTRP13569 1480 aa33.26■■■□□ 2.91
CTU2-204ENST00000564105 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.16■■■□□ 2.9
CTU2-204ENST00000564105 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.15■■■□□ 2.9
CTU2-204ENST00000564105 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.12■■■□□ 2.89
CTU2-204ENST00000564105 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.06■■■□□ 2.88
CTU2-204ENST00000564105 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.93■■■□□ 2.86
CTU2-204ENST00000564105 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.83■■■□□ 2.85
CTU2-204ENST00000564105 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.8■■■□□ 2.84
CTU2-204ENST00000564105 ABCC8Q09428 1581 aa32.79■■■□□ 2.84
CTU2-204ENST00000564105 WDR62O43379 1518 aa32.74■■■□□ 2.83
CTU2-204ENST00000564105 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.63■■■□□ 2.815e-6■■■■■ 29.2
CTU2-204ENST00000564105 SYNJ1O43426 1573 aa32.58■■■□□ 2.81
CTU2-204ENST00000564105 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.58■■■□□ 2.81
CTU2-204ENST00000564105 CUX1P39880 1505 aa32.58■■■□□ 2.81
CTU2-204ENST00000564105 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.57■■■□□ 2.8
CTU2-204ENST00000564105 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.57■■■□□ 2.8
CTU2-204ENST00000564105 TOP2BQ02880 1626 aa32.54■■■□□ 2.8
CTU2-204ENST00000564105 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.53■■■□□ 2.8
CTU2-204ENST00000564105 TOPBP1Q92547 1522 aa32.51■■■□□ 2.8
CTU2-204ENST00000564105 TRIM41Q8WV44 630 aa32.41■■■□□ 2.78
CTU2-204ENST00000564105 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.34■■■□□ 2.77
CTU2-204ENST00000564105 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.29■■■□□ 2.76
CTU2-204ENST00000564105 WDR97A6NE52 1622 aa32.15■■■□□ 2.74
CTU2-204ENST00000564105 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
CTU2-204ENST00000564105 SOGA1O94964 1423 aa32.14■■■□□ 2.74
CTU2-204ENST00000564105 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.14■■■□□ 2.74
CTU2-204ENST00000564105 IFT140Q96RY7 1462 aa32.08■■■□□ 2.73
CTU2-204ENST00000564105 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.04■■■□□ 2.72
CTU2-204ENST00000564105 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.03■■■□□ 2.72
CTU2-204ENST00000564105 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.91■■■□□ 2.7
CTU2-204ENST00000564105 OSCARQ8IYS5 282 aa31.9■■■□□ 2.7
CTU2-204ENST00000564105 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.88■■■□□ 2.69
CTU2-204ENST00000564105 KIF27Q86VH2 1401 aa31.88■■■□□ 2.69
CTU2-204ENST00000564105 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.88■■■□□ 2.69
CTU2-204ENST00000564105 PBRM1Q86U86 1689 aa31.86■■■□□ 2.69
CTU2-204ENST00000564105 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.86■■■□□ 2.69
CTU2-204ENST00000564105 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.81■■■□□ 2.68
CTU2-204ENST00000564105 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.8■■■□□ 2.681e-7■■■■■ 27.3
CTU2-204ENST00000564105 EEA1Q15075 1411 aa31.79■■■□□ 2.68
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CTU2-204ENST00000564105 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.69■■■□□ 2.66
CTU2-204ENST00000564105 GRIN2BQ13224 1484 aa31.67■■■□□ 2.66
CTU2-204ENST00000564105 CUL7Q14999 1698 aa31.64■■■□□ 2.65
CTU2-204ENST00000564105 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.62■■■□□ 2.65
CTU2-204ENST00000564105 IGF1RP08069 1367 aa31.62■■■□□ 2.65
CTU2-204ENST00000564105 CHD1O14646 1710 aa31.6■■■□□ 2.65
CTU2-204ENST00000564105 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.55■■■□□ 2.64
CTU2-204ENST00000564105 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.54■■■□□ 2.64
CTU2-204ENST00000564105 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.54■■■□□ 2.64
CTU2-204ENST00000564105 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.54■■■□□ 2.64
CTU2-204ENST00000564105 ADAMTS12P58397 1594 aa31.53■■■□□ 2.64
CTU2-204ENST00000564105 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.52■■■□□ 2.64
CTU2-204ENST00000564105 KIF21BO75037 1637 aa31.49■■■□□ 2.63
CTU2-204ENST00000564105 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.47■■■□□ 2.63
CTU2-204ENST00000564105 PRXQ9BXM0 1461 aa31.46■■■□□ 2.63
CTU2-204ENST00000564105 ARHGEF11O15085 1522 aa31.45■■■□□ 2.63
CTU2-204ENST00000564105 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.44■■■□□ 2.62
CTU2-204ENST00000564105 FBLN2P98095 1184 aa31.43■■■□□ 2.62
CTU2-204ENST00000564105 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.4■■■□□ 2.62
CTU2-204ENST00000564105 SYNJ2O15056 1496 aa31.38■■■□□ 2.61
CTU2-204ENST00000564105 GOLGA3Q08378 1498 aa31.31■■■□□ 2.6
CTU2-204ENST00000564105 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.3■■■□□ 2.6
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