RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592112.1

ROGDI-216, Transcript of rogdi homolog, humanhuman

TSL 2

Gene ROGDI, Length 968 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROGDI-216ENST00000592112 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.21■■■■■ 6.91
ROGDI-216ENST00000592112 ABCC9O60706 1549 aa52.35■■■■■ 5.97
ROGDI-216ENST00000592112 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.15■■■■■ 5.94
ROGDI-216ENST00000592112 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.75■■■■■ 5.55
ROGDI-216ENST00000592112 NACADO15069 1562 aa49.4■■■■■ 5.5
ROGDI-216ENST00000592112 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.36■■■■■ 5.49
ROGDI-216ENST00000592112 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.17■■■■■ 5.46
ROGDI-216ENST00000592112 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.81■■■■■ 5.4
ROGDI-216ENST00000592112 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.67■■■■■ 5.38
ROGDI-216ENST00000592112 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.47■■■■■ 5.35
ROGDI-216ENST00000592112 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.25■■■■■ 5.31
ROGDI-216ENST00000592112 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.21■■■■■ 5.31
ROGDI-216ENST00000592112 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.03■■■■■ 5.28
ROGDI-216ENST00000592112 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.62■■■■■ 5.21
ROGDI-216ENST00000592112 SCRIBQ14160 1630 aa47.6■■■■■ 5.21
ROGDI-216ENST00000592112 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.21■■■■■ 5.15
ROGDI-216ENST00000592112 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.16■■■■■ 5.14
ROGDI-216ENST00000592112 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.11■■■■■ 5.13
ROGDI-216ENST00000592112 NCAPD3P42695 1498 aa45.63■■■■■ 4.9
ROGDI-216ENST00000592112 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.49■■■■■ 4.87
ROGDI-216ENST00000592112 SMARCA4P51532 1647 aa45.37■■■■■ 4.85
ROGDI-216ENST00000592112 SMARCA2P51531 1590 aa45.34■■■■■ 4.85
ROGDI-216ENST00000592112 ERCC6Q03468 1493 aa45.23■■■■■ 4.83
ROGDI-216ENST00000592112 HMGXB3Q12766 1538 aa45.23■■■■■ 4.83
ROGDI-216ENST00000592112 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.2■■■■■ 4.83
ROGDI-216ENST00000592112 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.18■■■■■ 4.82
ROGDI-216ENST00000592112 CUX2O14529 1486 aa45.1■■■■■ 4.81
ROGDI-216ENST00000592112 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.06■■■■■ 4.8
ROGDI-216ENST00000592112 NESP48681 1621 aa44.93■■■■■ 4.78
ROGDI-216ENST00000592112 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.9■■■■■ 4.78
ROGDI-216ENST00000592112 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.85■■■■■ 4.77
ROGDI-216ENST00000592112 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.56■■■■■ 4.72
ROGDI-216ENST00000592112 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.41■■■■■ 4.7
ROGDI-216ENST00000592112 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.39■■■■■ 4.7
ROGDI-216ENST00000592112 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.29■■■■■ 4.68
ROGDI-216ENST00000592112 WIZO95785 1651 aa44.27■■■■■ 4.68
ROGDI-216ENST00000592112 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.25■■■■■ 4.67
ROGDI-216ENST00000592112 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.98■■■■■ 4.63
ROGDI-216ENST00000592112 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.94■■■■■ 4.62
ROGDI-216ENST00000592112 WDR62O43379 1518 aa43.83■■■■■ 4.61
ROGDI-216ENST00000592112 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.81■■■■■ 4.6
ROGDI-216ENST00000592112 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.76■■■■■ 4.6
ROGDI-216ENST00000592112 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.73■■■■■ 4.59
ROGDI-216ENST00000592112 CFTRP13569 1480 aa43.73■■■■■ 4.59
ROGDI-216ENST00000592112 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.37■■■■■ 4.53
ROGDI-216ENST00000592112 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.28■■■■■ 4.52
ROGDI-216ENST00000592112 TRIM41Q8WV44 630 aa43.28■■■■■ 4.52
ROGDI-216ENST00000592112 OSCARQ8IYS5 282 aa43.15■■■■■ 4.5
ROGDI-216ENST00000592112 PRDM2Q13029 1718 aa43.12■■■■■ 4.49
ROGDI-216ENST00000592112 IFT140Q96RY7 1462 aa42.94■■■■■ 4.47
ROGDI-216ENST00000592112 TOPBP1Q92547 1522 aa42.91■■■■■ 4.46
ROGDI-216ENST00000592112 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.87■■■■■ 4.45
ROGDI-216ENST00000592112 ABCC8Q09428 1581 aa42.83■■■■■ 4.45
ROGDI-216ENST00000592112 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.72■■■■■ 4.43
ROGDI-216ENST00000592112 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.56■■■■■ 4.4
ROGDI-216ENST00000592112 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.51■■■■■ 4.4
ROGDI-216ENST00000592112 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.47■■■■■ 4.39
ROGDI-216ENST00000592112 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.46■■■■■ 4.39
ROGDI-216ENST00000592112 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.44■■■■■ 4.38
ROGDI-216ENST00000592112 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.44■■■■■ 4.38
ROGDI-216ENST00000592112 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.44■■■■■ 4.38
ROGDI-216ENST00000592112 FBLN2P98095 1184 aa42.35■■■■■ 4.37
ROGDI-216ENST00000592112 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.35■■■■■ 4.37
ROGDI-216ENST00000592112 SOGA1O94964 1423 aa42.34■■■■■ 4.37
ROGDI-216ENST00000592112 ARHGEF11O15085 1522 aa42.34■■■■■ 4.37
ROGDI-216ENST00000592112 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.27■■■■■ 4.36
ROGDI-216ENST00000592112 CHD1O14646 1710 aa42.22■■■■■ 4.35
ROGDI-216ENST00000592112 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.2■■■■■ 4.35
ROGDI-216ENST00000592112 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.17■■■■■ 4.34
ROGDI-216ENST00000592112 CUX1P39880 1505 aa42.13■■■■■ 4.33
ROGDI-216ENST00000592112 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.1■■■■■ 4.33
ROGDI-216ENST00000592112 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.05■■■■■ 4.32
ROGDI-216ENST00000592112 WDR97A6NE52 1622 aa42.03■■■■■ 4.32
ROGDI-216ENST00000592112 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.01■■■■■ 4.32
ROGDI-216ENST00000592112 GRIN2BQ13224 1484 aa41.94■■■■■ 4.3
ROGDI-216ENST00000592112 ARAP1Q96P48 1450 aa41.92■■■■■ 4.3
ROGDI-216ENST00000592112 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.92■■■■■ 4.3
ROGDI-216ENST00000592112 SYNJ1O43426 1573 aa41.8■■■■■ 4.28
ROGDI-216ENST00000592112 SYNJ2O15056 1496 aa41.79■■■■■ 4.28
ROGDI-216ENST00000592112 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.79■■■■■ 4.28
ROGDI-216ENST00000592112 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.77■■■■■ 4.28
ROGDI-216ENST00000592112 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.74■■■■■ 4.27
ROGDI-216ENST00000592112 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.71■■■■■ 4.27
ROGDI-216ENST00000592112 PBRM1Q86U86 1689 aa41.64■■■■■ 4.26
ROGDI-216ENST00000592112 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.59■■■■■ 4.25
ROGDI-216ENST00000592112 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.58■■■■■ 4.25
ROGDI-216ENST00000592112 TOP2BQ02880 1626 aa41.42■■■■■ 4.22
ROGDI-216ENST00000592112 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.39■■■■■ 4.22
ROGDI-216ENST00000592112 GRIN2AQ12879 1464 aa41.38■■■■■ 4.21
ROGDI-216ENST00000592112 ADAMTS12P58397 1594 aa41.3■■■■■ 4.2
ROGDI-216ENST00000592112 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.27■■■■■ 4.2
ROGDI-216ENST00000592112 NUP160Q12769 1436 aa41.24■■■■■ 4.19
ROGDI-216ENST00000592112 CEP170Q5SW79 1584 aa41.19■■■■■ 4.18
ROGDI-216ENST00000592112 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.18■■■■■ 4.18
ROGDI-216ENST00000592112 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.14■■■■■ 4.18
ROGDI-216ENST00000592112 SHROOM2Q13796 1616 aa40.98■■■■■ 4.15
ROGDI-216ENST00000592112 JPH4Q96JJ6 628 aa40.92■■■■■ 4.14
ROGDI-216ENST00000592112 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.9■■■■■ 4.14
ROGDI-216ENST00000592112 KIF27Q86VH2 1401 aa40.72■■■■■ 4.11
ROGDI-216ENST00000592112 IGF1RP08069 1367 aa40.71■■■■■ 4.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms