RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.74■■■■■ 4.43
IMP4-208ENST00000460766 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.38■■■■□ 3.41
IMP4-208ENST00000460766 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.36■■■■□ 3.41
IMP4-208ENST00000460766 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.37
IMP4-208ENST00000460766 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.65■■■■□ 3.3
IMP4-208ENST00000460766 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.52■■■■□ 3.28
IMP4-208ENST00000460766 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.07■■■■□ 3.2
IMP4-208ENST00000460766 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.58■■■■□ 3.13
IMP4-208ENST00000460766 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.38■■■■□ 3.09
IMP4-208ENST00000460766 SCRIBQ14160 1630 aa34.09■■■■□ 3.05
IMP4-208ENST00000460766 ABCC9O60706 1549 aa34.07■■■■□ 3.04
IMP4-208ENST00000460766 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.79■■■■□ 3
IMP4-208ENST00000460766 NACADO15069 1562 aa33.68■■■□□ 2.98
IMP4-208ENST00000460766 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa33.55■■■□□ 2.96
IMP4-208ENST00000460766 PCGF6Q9BYE7 350 aa33.42■■■□□ 2.94
IMP4-208ENST00000460766 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.39■■■□□ 2.94
IMP4-208ENST00000460766 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.33■■■□□ 2.93
IMP4-208ENST00000460766 HRCP23327 699 aa33.33■■■□□ 2.93
IMP4-208ENST00000460766 TRIM41Q8WV44 630 aa33.23■■■□□ 2.91
IMP4-208ENST00000460766 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.21■■■□□ 2.91
IMP4-208ENST00000460766 WIZO95785 1651 aa33.01■■■□□ 2.87
IMP4-208ENST00000460766 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.94■■■□□ 2.86
IMP4-208ENST00000460766 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.85■■■□□ 2.85
IMP4-208ENST00000460766 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP32.82■■■□□ 2.84
IMP4-208ENST00000460766 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.66■■■□□ 2.82
IMP4-208ENST00000460766 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP32.63■■■□□ 2.81
IMP4-208ENST00000460766 SMARCA4P51532 1647 aa32.56■■■□□ 2.8
IMP4-208ENST00000460766 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.55■■■□□ 2.8
IMP4-208ENST00000460766 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.52■■■□□ 2.8
IMP4-208ENST00000460766 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.5■■■□□ 2.79
IMP4-208ENST00000460766 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.39■■■□□ 2.78
IMP4-208ENST00000460766 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.33■■■□□ 2.77
IMP4-208ENST00000460766 SMARCA2P51531 1590 aa32.32■■■□□ 2.77
IMP4-208ENST00000460766 ABCC8Q09428 1581 aa32.25■■■□□ 2.75
IMP4-208ENST00000460766 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.21■■■□□ 2.75
IMP4-208ENST00000460766 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP32.07■■■□□ 2.72
IMP4-208ENST00000460766 SOGA1O94964 1423 aa31.95■■■□□ 2.7
IMP4-208ENST00000460766 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.93■■■□□ 2.7
IMP4-208ENST00000460766 EEA1Q15075 1411 aa31.8■■■□□ 2.68
IMP4-208ENST00000460766 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.79■■■□□ 2.68
IMP4-208ENST00000460766 CEP162Q5TB80 1403 aa31.77■■■□□ 2.68
IMP4-208ENST00000460766 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.77■■■□□ 2.68
IMP4-208ENST00000460766 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.77■■■□□ 2.68
IMP4-208ENST00000460766 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.77■■■□□ 2.68
IMP4-208ENST00000460766 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.73■■■□□ 2.67
IMP4-208ENST00000460766 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.7■■■□□ 2.67
IMP4-208ENST00000460766 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
IMP4-208ENST00000460766 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.58■■■□□ 2.65
IMP4-208ENST00000460766 GOLGA3Q08378 1498 aa31.57■■■□□ 2.65
IMP4-208ENST00000460766 SYNJ1O43426 1573 aa31.57■■■□□ 2.64
IMP4-208ENST00000460766 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP31.53■■■□□ 2.64
IMP4-208ENST00000460766 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP31.47■■■□□ 2.63
IMP4-208ENST00000460766 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.41■■■□□ 2.62
IMP4-208ENST00000460766 KIF21BO75037 1637 aa31.33■■■□□ 2.61
IMP4-208ENST00000460766 CLIP1P30622 1438 aa31.21■■■□□ 2.59
IMP4-208ENST00000460766 TOP2BQ02880 1626 aa31.2■■■□□ 2.59
IMP4-208ENST00000460766 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.18■■■□□ 2.58
IMP4-208ENST00000460766 NCAPD3P42695 1498 aa31.17■■■□□ 2.58
IMP4-208ENST00000460766 HMGXB3Q12766 1538 aa31.15■■■□□ 2.58
IMP4-208ENST00000460766 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP31.07■■■□□ 2.56
IMP4-208ENST00000460766 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.07■■■□□ 2.56
IMP4-208ENST00000460766 VPS8Q8N3P4 1428 aa31.06■■■□□ 2.56
IMP4-208ENST00000460766 APLP2Q06481 763 aa30.98■■■□□ 2.55
IMP4-208ENST00000460766 CUX1P39880 1505 aa30.93■■■□□ 2.54
IMP4-208ENST00000460766 CFTRP13569 1480 aa30.9■■■□□ 2.54
IMP4-208ENST00000460766 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
IMP4-208ENST00000460766 PRXQ9BXM0 1461 aa30.89■■■□□ 2.54
IMP4-208ENST00000460766 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.87■■■□□ 2.53
IMP4-208ENST00000460766 KIF27Q86VH2 1401 aa30.81■■■□□ 2.52
IMP4-208ENST00000460766 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.51
IMP4-208ENST00000460766 ARAP1Q96P48 1450 aa30.69■■■□□ 2.5
IMP4-208ENST00000460766 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
IMP4-208ENST00000460766 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.59■■■□□ 2.49
IMP4-208ENST00000460766 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
IMP4-208ENST00000460766 PRDM2Q13029 1718 aa30.55■■■□□ 2.48
IMP4-208ENST00000460766 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
IMP4-208ENST00000460766 CUX2O14529 1486 aa30.53■■■□□ 2.48
IMP4-208ENST00000460766 IGF1RP08069 1367 aa30.46■■■□□ 2.47
IMP4-208ENST00000460766 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.46■■■□□ 2.47
IMP4-208ENST00000460766 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.42■■■□□ 2.46
IMP4-208ENST00000460766 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.41■■■□□ 2.46
IMP4-208ENST00000460766 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
IMP4-208ENST00000460766 NEUROD1Q13562 356 aa30.36■■■□□ 2.45
IMP4-208ENST00000460766 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.35■■■□□ 2.45
IMP4-208ENST00000460766 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
IMP4-208ENST00000460766 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
IMP4-208ENST00000460766 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.29■■■□□ 2.44
IMP4-208ENST00000460766 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
IMP4-208ENST00000460766 CLSPNQ9HAW4 1339 aa30.22■■■□□ 2.43
IMP4-208ENST00000460766 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.22■■■□□ 2.43
IMP4-208ENST00000460766 ITGAEP38570 1179 aa30.14■■■□□ 2.42
IMP4-208ENST00000460766 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.12■■■□□ 2.41
IMP4-208ENST00000460766 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.11■■■□□ 2.41
IMP4-208ENST00000460766 TIAM1Q13009 1591 aa30.1■■■□□ 2.41
IMP4-208ENST00000460766 MIER1Q8N108 512 aa30.1■■■□□ 2.41
IMP4-208ENST00000460766 NESP48681 1621 aa30.09■■■□□ 2.41
IMP4-208ENST00000460766 TOPBP1Q92547 1522 aa30.07■■■□□ 2.4
IMP4-208ENST00000460766 MAP3K1Q13233 1512 aa30.06■■■□□ 2.4
IMP4-208ENST00000460766 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
IMP4-208ENST00000460766 P3H3Q8IVL6 736 aa30.06■■■□□ 2.4
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