Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms