Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN3P07498 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN3P07498 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN3P07498 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN3P07498 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN3P07498 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN3P07498 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN3P07498 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN3P07498 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN3P07498 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN3P07498 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN3P07498 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN3P07498 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN3P07498 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN3P07498 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN3P07498 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN3P07498 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN3P07498 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN3P07498 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN3P07498 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN3P07498 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN3P07498 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN3P07498 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN3P07498 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN3P07498 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN3P07498 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSN3P07498 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSN3P07498 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSN3P07498 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSN3P07498 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSN3P07498 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSN3P07498 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSN3P07498 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSN3P07498 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSN3P07498 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSN3P07498 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN3P07498 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN3P07498 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN3P07498 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN3P07498 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN3P07498 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN3P07498 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN3P07498 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN3P07498 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN3P07498 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN3P07498 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN3P07498 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN3P07498 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN3P07498 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN3P07498 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN3P07498 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN3P07498 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN3P07498 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN3P07498 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN3P07498 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN3P07498 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN3P07498 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN3P07498 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN3P07498 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN3P07498 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN3P07498 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSN3P07498 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN3P07498 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN3P07498 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN3P07498 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN3P07498 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN3P07498 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN3P07498 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN3P07498 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN3P07498 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN3P07498 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN3P07498 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN3P07498 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN3P07498 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN3P07498 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN3P07498 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN3P07498 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN3P07498 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN3P07498 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN3P07498 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN3P07498 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN3P07498 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN3P07498 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN3P07498 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN3P07498 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN3P07498 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN3P07498 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN3P07498 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN3P07498 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN3P07498 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN3P07498 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN3P07498 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN3P07498 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN3P07498 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN3P07498 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN3P07498 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN3P07498 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN3P07498 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN3P07498 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN3P07498 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms