Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR12

PDLIM7, PDZ and LIM domain protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM7Q9NR12 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDLIM7Q9NR12 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms