Protein–RNA interactions for Protein: Q99766

ATP5S, ATP synthase subunit s, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5SQ99766 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP5SQ99766 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms