Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TSKUQ8WUA8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TSKUQ8WUA8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms