Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms