Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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