Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms