Protein–RNA interactions for Protein: Q96KK3

KCNS1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1Q96KK3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS1Q96KK3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS1Q96KK3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS1Q96KK3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS1Q96KK3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS1Q96KK3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS1Q96KK3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS1Q96KK3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS1Q96KK3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS1Q96KK3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS1Q96KK3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS1Q96KK3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNS1Q96KK3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNS1Q96KK3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.05■□□□□ 0
KCNS1Q96KK3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNS1Q96KK3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KCNS1Q96KK3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNS1Q96KK3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KCNS1Q96KK3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KCNS1Q96KK3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNS1Q96KK3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNS1Q96KK3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNS1Q96KK3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KCNS1Q96KK3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS1Q96KK3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms