Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPBLQ6KC79 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.221e-8■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.232e-6■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 RHOA-205ENST00000445425 633 ntTSL 313.49□□□□□ -0.251e-13■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.272e-6■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.271e-13■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.312e-6■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 MICALL2-215ENST00000496184 2722 ntTSL 213.07□□□□□ -0.321e-8■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.347e-10■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 HK1-205ENST00000436817 1042 ntTSL 512.93□□□□□ -0.341e-8■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.342e-6■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.351e-8■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 NR1H2-203ENST00000593532 2380 ntTSL 212.83□□□□□ -0.362e-6■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 SLC25A39-217ENST00000593166 797 ntTSL 312.77□□□□□ -0.362e-6■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 NR1H2-212ENST00000600355 507 ntTSL 312.55□□□□□ -0.42e-6■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.441e-8■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 PRAME-209ENST00000439106 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 312.18□□□□□ -0.464e-11■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.484e-11■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 PRAME-207ENST00000420709 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 211.68□□□□□ -0.544e-11■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 PRAME-211ENST00000476336 589 ntTSL 211.65□□□□□ -0.544e-11■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.567e-10■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 MRPS25-202ENST00000420267 590 ntTSL 411.55□□□□□ -0.561e-8■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 MICALL2-214ENST00000493998 404 ntTSL 211.43□□□□□ -0.581e-8■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 PRAME-204ENST00000403441 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 311.4□□□□□ -0.584e-11■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 GTF3C2-204ENST00000423998 828 ntTSL 511.4□□□□□ -0.591e-8■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.611e-8■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 PRMT3-201ENST00000330796 2530 ntTSL 1 (best)11.01□□□□□ -0.652e-6■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.657e-10■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 PRAME-210ENST00000442481 581 ntTSL 310.92□□□□□ -0.664e-11■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.684e-11■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.694e-11■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 ARL4A-202ENST00000396662 1296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.742e-6■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 CPNE7-205ENST00000529800 519 ntTSL 510.38□□□□□ -0.757e-10■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.772e-6■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.782e-6■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 GTF3C2-208ENST00000457748 557 ntTSL 59.94□□□□□ -0.821e-8■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.824e-11■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 SLC25A39-213ENST00000591006 2217 ntTSL 29.9□□□□□ -0.822e-6■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 ARL4A-203ENST00000396663 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.862e-6■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 AC008443.1-204ENST00000417281 629 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.877e-10■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 PRAME-213ENST00000492657 2831 ntTSL 1 (best)9.59□□□□□ -0.874e-11■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.892e-6■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 PRAME-203ENST00000402697 2057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.924e-11■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 RHOA-203ENST00000422781 961 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.931e-13■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 PRAME-201ENST00000398741 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.954e-11■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 PBX2-203ENST00000480254 580 ntTSL 28.88□□□□□ -0.992e-6■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -12e-6■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 NME2-209ENST00000573262 789 ntTSL 1 (best)8.76□□□□□ -1.017e-10■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 PRMT3-203ENST00000437750 1736 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.072e-6■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 AC013474.1-201ENST00000440018 799 ntBASIC8.32□□□□□ -1.082e-6■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 EXO1-202ENST00000366548 3473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.192e-6■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 ATAD5-202ENST00000578295 4051 ntTSL 1 (best)7.54□□□□□ -1.21e-8■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 MACF1-234ENST00000641012 4284 ntBASIC7.49□□□□□ -1.212e-6■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 GTF3C2-201ENST00000264720 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.211e-8■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 MRPS25-201ENST00000253686 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.221e-8■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 MRPS25-205ENST00000449354 1119 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.241e-8■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 ARL4A-201ENST00000356797 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.272e-6■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 HMMR-205ENST00000517936 528 ntTSL 27.05□□□□□ -1.282e-6■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 GTF3C2-202ENST00000359541 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.391e-8■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 HNRNPK-201ENST00000351839 2652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.41e-8■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 FLJ46284-202ENST00000521148 496 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.42e-6■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 HNRNPK-205ENST00000376281 2928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.441e-8■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 AC008443.1-205ENST00000599439 1868 nt6□□□□□ -1.457e-10■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 MACF1-230ENST00000530275 5767 nt5.9□□□□□ -1.462e-6■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 ATAD5-201ENST00000321990 6869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.591e-8■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 HNRNPK-207ENST00000472778 822 ntTSL 35.13□□□□□ -1.591e-8■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 HNRNPK-209ENST00000483135 900 ntTSL 25.13□□□□□ -1.591e-8■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.672e-6■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.72e-6■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.81e-8■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 PRMT3-206ENST00000529592 4159 ntTSL 23.82□□□□□ -1.82e-6■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.822e-6■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 PHF3-207ENST00000505138 612 ntTSL 33.69□□□□□ -1.822e-6■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.832e-6■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.852e-6■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 SMC6-208ENST00000481708 3897 ntTSL 22.31□□□□□ -2.041e-8■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.522e-6■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 HSP90B1-209ENST00000552051 581 ntTSL 27.94□□□□□ -1.141e-323■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.472e-8■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 P4HB-216ENST00000571617 505 ntTSL 318.37■□□□□ 0.537e-7■□□□□ 9.6
NIPBLQ6KC79 P4HB-219ENST00000574914 571 ntTSL 418.37■□□□□ 0.537e-7■□□□□ 9.6
NIPBLQ6KC79 P4HB-224ENST00000576541 571 ntTSL 518.37■□□□□ 0.537e-7■□□□□ 9.6
NIPBLQ6KC79 P4HB-222ENST00000576380 943 ntTSL 317.41■□□□□ 0.387e-7■□□□□ 9.6
NIPBLQ6KC79 P4HB-221ENST00000576052 562 ntTSL 417.12■□□□□ 0.337e-7■□□□□ 9.6
NIPBLQ6KC79 P4HB-217ENST00000573778 688 ntTSL 516.32■□□□□ 0.27e-7■□□□□ 9.6
NIPBLQ6KC79 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.067e-7■□□□□ 9.6
NIPBLQ6KC79 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.211e-13■□□□□ 9.6
NIPBLQ6KC79 EIF4A1-207ENST00000578324 1577 ntTSL 511.81□□□□□ -0.521e-13■□□□□ 9.6
NIPBLQ6KC79 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.541e-13■□□□□ 9.6
NIPBLQ6KC79 EIF4A1-225ENST00000582746 1645 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.711e-13■□□□□ 9.6
NIPBLQ6KC79 AC016876.2-201ENST00000581621 4554 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.121e-13■□□□□ 9.6
NIPBLQ6KC79 SENP3-EIF4A1-201ENST00000614237 3519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.171e-13■□□□□ 9.6
NIPBLQ6KC79 CHD2-207ENST00000626782 2131 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.153e-9■□□□□ 9.6
NIPBLQ6KC79 AC013394.1-202ENST00000630790 4499 ntTSL 25.75□□□□□ -1.493e-9■□□□□ 9.6
NIPBLQ6KC79 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.513e-9■□□□□ 9.6
NIPBLQ6KC79 CHD2-227ENST00000637572 4452 ntTSL 54.18□□□□□ -1.743e-9■□□□□ 9.6
NIPBLQ6KC79 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.793e-9■□□□□ 9.6
NIPBLQ6KC79 CHD2-221ENST00000635856 4236 ntTSL 53.85□□□□□ -1.793e-9■□□□□ 9.6
NIPBLQ6KC79 CHD2-228ENST00000637613 986 ntTSL 51.54□□□□□ -2.163e-9■□□□□ 9.6
NIPBLQ6KC79 WARS-243ENST00000557722 848 ntTSL 513.39□□□□□ -0.276e-6■□□□□ 9.6
NIPBLQ6KC79 WARS-229ENST00000556435 528 ntTSL 212.52□□□□□ -0.416e-6■□□□□ 9.6
Retrieved 100 of 8,528 protein–RNA pairs in 44.6 ms