Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCLP19338 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCLP19338 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCLP19338 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCLP19338 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCLP19338 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCLP19338 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NCLP19338 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCLP19338 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCLP19338 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCLP19338 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCLP19338 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCLP19338 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCLP19338 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCLP19338 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCLP19338 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCLP19338 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCLP19338 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCLP19338 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCLP19338 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCLP19338 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCLP19338 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCLP19338 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCLP19338 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCLP19338 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCLP19338 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCLP19338 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCLP19338 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCLP19338 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCLP19338 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCLP19338 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCLP19338 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCLP19338 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCLP19338 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCLP19338 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCLP19338 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCLP19338 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NCLP19338 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCLP19338 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCLP19338 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NCLP19338 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCLP19338 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCLP19338 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCLP19338 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCLP19338 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCLP19338 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCLP19338 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCLP19338 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCLP19338 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCLP19338 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCLP19338 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCLP19338 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCLP19338 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCLP19338 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCLP19338 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCLP19338 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCLP19338 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCLP19338 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NCLP19338 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCLP19338 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCLP19338 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCLP19338 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCLP19338 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCLP19338 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCLP19338 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCLP19338 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NCLP19338 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCLP19338 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCLP19338 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCLP19338 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCLP19338 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCLP19338 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCLP19338 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCLP19338 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCLP19338 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCLP19338 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCLP19338 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCLP19338 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCLP19338 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCLP19338 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCLP19338 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCLP19338 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCLP19338 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCLP19338 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCLP19338 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NCLP19338 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCLP19338 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCLP19338 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCLP19338 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCLP19338 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCLP19338 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCLP19338 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCLP19338 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCLP19338 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCLP19338 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCLP19338 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCLP19338 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCLP19338 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCLP19338 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCLP19338 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms