Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ESRRAP11474 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ESRRAP11474 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ESRRAP11474 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ESRRAP11474 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ESRRAP11474 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ESRRAP11474 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ESRRAP11474 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ESRRAP11474 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ESRRAP11474 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ESRRAP11474 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ESRRAP11474 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ESRRAP11474 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ESRRAP11474 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ESRRAP11474 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ESRRAP11474 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ESRRAP11474 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ESRRAP11474 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ESRRAP11474 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ESRRAP11474 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ESRRAP11474 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ESRRAP11474 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ESRRAP11474 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ESRRAP11474 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ESRRAP11474 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ESRRAP11474 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ESRRAP11474 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ESRRAP11474 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ESRRAP11474 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ESRRAP11474 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ESRRAP11474 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ESRRAP11474 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ESRRAP11474 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ESRRAP11474 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ESRRAP11474 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ESRRAP11474 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ESRRAP11474 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ESRRAP11474 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ESRRAP11474 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ESRRAP11474 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ESRRAP11474 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ESRRAP11474 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ESRRAP11474 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ESRRAP11474 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ESRRAP11474 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms